Chương trình Đào tạo thạc sỹ chuyên ngành Kỹ thuật hạt nhân cung cấp cho học viên một số kiến thức cơ sở nâng cao về Kỹ thuật hạt nhân, đặc biệt là ứng dụng Kỹ thuật hạt nhân trong đời sống. Sau khi tốt nghiệp, học viên có phương pháp tư duy hệ thống, có kiến thức khoa học cơ bản và kỹ thuật cơ sở vững chắc. Với các học viên ME được trang bị kỹ năng thực hành, khả năng thích ứng với môi trường kinh tế-xã hội, giải quyết những vấn đề khoa học và kỹ thuật tại đơn vị công tác.